Aleksandras Kuznecovas. Kas yra „rizofagijos ciklas“ ir rizofagija? Endobiomas. Endofitas. Maistinių medžiagų transportavimas. Aktyvus deguonis. Rizosfera. Simbiozė.

Kas yra „rizofagijos ciklas“ ir rizofagija?

Tiesą sakant, jie nėra tas pats dalykas. Daugelis ūkininkų, perskaitę mokslininkų straipsniį, nusprendžia, kad kalbame apie mikrobus, valgančius augalų šaknis. Bet tai tik vertimo klaida (pavyzdžiui, Google vertimas yra toks: Rhizophagic cycle: oksidacinis procesas augaluose, siekiant išgauti maistines medžiagas iš simbiotinių mikrobų). Arba netikslus terminas, kurį mokslininkai taikė augalų ir mikrobų simbiotinių ryšių procesui. Tiksliau, „maisto medžiagų perdavimo iš simbiotinių mikrobų (bakterijų ir grybų) į augalų šeimininkų šaknis mechanizmas“ kažkodėl buvo vadinamas „rizofagijos ciklu“? Ir mes kalbame apie tai, kaip „rizofagijos cikle mikrobai pakaitomis keičiasi tarp šaknų intracelulinės endofitinės fazės ir laisvai gyvenančios dirvožemio fazės“. Tai yra, kaip tokios simbiozės metu saprofitų mikrobai keičia savo formą ir „gyvenamąją vietą“, virsdami endofitais..

Straipsnio schema:

Nors prieš tai ji jau egzistavo klasifikacija tarp fagų (pažodžiui „ryjantys“). Kur dar yra rizofagai – šaknų valgytojai:

Dendrofagai – medžių ir krūmų vartotojų

rizofagas – šakninių vartotojų
Ksilofagas – medienos vartotojų
fleofagai – floemo ir žievės vartotojų
limfofagai – gyvų augalų sulčių vartotojų
filofagas – lapų vartotojai
antofagas – gėlių vartotojų

himenofagai – generatyvinių organų vartotojai
palinofagai (pollinofagai) – žiedadulkių vartotojų
nektarivalgiai – nektaro vartotojų
karpofagas – vaisių ir sėklų vartotojų

Kyla klausimas: kodėl reikėjo tai pakeisti ar įvesti painiavos į jau egzistuojančius terminus? Nepaisant to, kad originalus straipsnis yra visiškai apie kitus procesus, o ne apie šaknų rijimą/valgymą.

Bet grįžkime prie straipsnio. Ir atkreipkime dėmesį į raktinius žodžius:
endobiomas; endofitas; maistinių medžiagų transportavimas; aktyvus deguonis; rizosfera; simbiozė. Straipsnyje kaip tik apie tai ir kalbama apie ypatingą atvejį.

Pažiūrėkime, kas tai yra? Pradėkime nuo endofitų.

Nuoroda. Trumpai tariant::

“Endofitai yra mikroorganizmai, gyvenantys audiniuose Augalai Kaip endosimbiontai, nesukelia simptomų Ligos. Kai kurie iš jų yra abipusis simbiontai, turintys teigiamą poveikį jų šeimininkui, pvz., geresnis augimas arba atsparumas ligoms, arba aplinkos stresas, ir naudojami kaip mikrobiniai inokuliantai. Tačiau patogenų Ir saprofitai taip pat gali būti endofitinis tam tikru jų gyvenimo ciklo etapu. Endofitai skiriasi nuo mikorizėgrybai arba rizosfera mikrobai, nes jie gyvena tik augalo viduje. Dauguma žinomų endofitų yra Bakterijos arba grybai, nors yra ir kai kurių endofitinių Jūros dumbliai Ir Oomycetes“.

Daugiau tokių detalių:

Endofitai (nuo Senasis graikas. ἔνδον “viduje”» + φυτόν «Augalas»[1]) — Mikroorganizmai, tam tikromis aplinkybėmis gyvena audiniai gyvas augalai, nesukeliant jokių neigiamų pasekmių jų funkcionavimui ir vystymuisi. Tokie organizmai gali apimti grybai Ir Bakterijos, rečiau Jūros dumbliai Ir virusai.

Terminas buvo sukurtas 1866 m Antonas de Baris reiškia visus organizmus, visiškai arba iš dalies aptinkamus augalų audiniuose. Tradiciškai endofitai taip pat apėmė endotrofinius grybus mikorizė, šiuo metu šis terminas jų atžvilgiu paprastai nevartojamas.

Endofitų ir augalų asociacija dažnai apibūdinama kaip pavyzdys simbiozė. Endofitinis mikroorganizmas išskiria augalų augimą skatinančias medžiagas (pvz, acetobakterijųAcetobacter diazotrophicus, gyvenantys audiniuose cukranendrės, nežinomu mechanizmu gali atmosferos azoto fiksacija) arba antibiotines medžiagas, kurios slopina patogenų vystymąsi arba neleidžia užkrėsti sveiko augalo patogenais, o užpildo sunkiai pasiekiamas ir saugus. ekologinė niša.

Endofitai randami tiek audiniuose žydintys augalai, taigi viduje dumbliai, Į samanos Ir kepenėlės, V paparčiai. Yra privalomi ir fakultatyviniai endofitai. Privalomus mikroorganizmus sunku išskirti ir jie gali egzistuoti tik augalų viduje. Fakultatyviniai endofitai yra organizmai, kurie gali egzistuoti augale nepadarydami jam žalos, tačiau kitomis aplinkybėmis, pavyzdžiui, kai augalas serga depresija, jie tampa Patogenai arba saprotrofai.

Endofitai gali išplisti, kai augalo audinio išorėje susidaro sporos, užkrėsdamos naujus augalus. Tokie endofitai konkuruoja dėl neužimtų ekologinių nišų. Kiti endofitiniai grybai, pvz., spp. Epichloė (taip pat jų anamorfai Neotifodiumas), prasiskverbti į visus augalų audinius, įskaitant jų Sėklos, plinta su jais. Dėl to grybeliu jau yra užsikrėtę augalai visais vystymosi etapais.

Pavyzdžiui: endofitų sąrašas.

Daugiau informacijos.

“Endofitinės bakterijos yra bakterijos, gyvenančios augalų vidaus audiniuose ir organuose. Paprastai juos galima rasti tarpląstelinėje erdvėje. Jų ekologinis vaidmuo yra atlikti daugybę augalų šeimininkui svarbių funkcijų, įskaitant: azoto fiksavimą, augimo reguliatorių gamybą, dalyvavimą imuninėse reakcijose ir apsaugą nuo abiotinio streso..

Daugelis endofitų yra gerai žinomų dirvožemio bakterijų iš Pseudomonas, Burkholderia ir Bacillus genčių atstovai. Šios gentys yra gerai žinomos kaip antrinių bakterinių metabolitų, tokių kaip antibiotikai, priešvėžiniai vaistai, lakiieji organiniai junginiai, fungicidiniai, insekticidiniai ir imunosupresiniai agentai, gamintojai. Nors iš endofitinių bakterijų buvo išskirta gana daug biologiškai aktyvių medžiagų, jos vis dar lieka nepakankamai išnaudotu tokių medžiagų šaltiniu..”

Na ir t.t. Tai savaime kalba apie augalų ir mikrobų, įskaitant bakterijas ir grybus, simbiozę. Be to, kad yra mikrogrybelių, kurie formuoja endomikorizę su augalais.

Papildoma medžiaga šia tema.

ENDOFITINIŲ BAKTERIJŲ BIOLOGINĖ ĮVAIROVĖ: daug žadantis BIOTECHNOLOGINIS IŠTEKLIS

Rizofagas

Rizofagijos ciklas: Oksidacinis procesas augaluose, skirtas maistinėms medžiagoms išgauti iš simbiotinių mikrobų

PS Panašūs straipsniai (straipsnių vertimas žemiau komentaruose):

• Endofitų vaidmuo maisto medžiagų įsisavinimui, šaknų sistemos architektūros vystymuisi ir atsparumui oksidaciniam stresui.Verma SK, Sahu PK, Kumar K, Pal J, Gond SK, Kharwar RN, White JF. 2021 m. lapkritis; 131 (5): 2161-2177. doi: 10.1111/jam.15111. Epub 2021 gegužės 17 d. PMID: 33893707 Apžvalga.
• Apžvalga: Endofitiniai mikrobai ir galimi jų pritaikymai augalininkystėje.White J.F., Kingsley K.L., Zhang K., Verma R., Obi N., Dvinskikh S., Elmore M.T., Verma S.K., Gond S.K., Kowalski K.P.Pest Management Sci. 2019 m. spalis;75(10):2558-2565. doi: 10.1002/ps.5527. Epub, 2019 m. liepos 27 d. ID: 31228333 Nemokamas straipsnis apie PMC. Apžvalga.
• Endofitinis Pseudomonas sp. iš Agavė Palmeri Dalyvaukite rizofagijos cikle ir veikia kaip biostimuliatoriai žemės ūkio augaluose.Zhang Q, Kingsley KL, White JF Biology (Bazelis). 2022 m., gruodžio 9 d.; 11 (12): 1790. doi: 10.3390/biology11121790.PMID: 36552299 Nemokamas straipsnis apie PMC.
• Endofitinis mikrobas iš neįprastų vulkaninių pelkių kukurūzų ieško ir gyvena šaknų plaukų ląstelėse, kad išgautų akmens fosfatą..Shehata HR, Dumigan S, Watts S, Raizada MN Sci Rep. 2017 m. spalio 18 d.;7(1):13479. doi: 10.1038/s41598-017-14080-x.PMID: 29044186 Nemokamas straipsnis apie PMC.
• Nod faktoriaus poveikis Medicago truncatula šaknies plaukams būdingam transkriptui: dėmesys plazmos membranos transportavimo sistemoms ir reaktyviųjų deguonies rūšių tinklams.Damiani I, Drane A, Guichard M, Balzergue S, Boscari A, Boyer HK, Bruno V, Cottaz S, Rancourel C, Da Rocha M, Fizames C, Fort S, Gaillard I, Maillol V., Danchin E.G., Rouache H. , Samain E, Su Y.H., Tuen J., Touraine B., Puppo A., Frachisse J.M., Poli N., Sentenac H. Front Plant Scientific. 2016, birželio 7 d.; 7:794. doi: 10.3389/fpls.2016.00794. Elektroninė kolekcija 2016.PMID: 27375649 Nemokamas straipsnis apie PMC.
• Bioinokuliantų ir nanodalelių potencialo išlaisvinimas tvariame žemės ūkyje, siekiant pagerinti augalų augimą ir maisto saugumą.Carnval A, Doru A, Malik T. Biomed Res Int. 2023 m. lapkričio 29 d.; 2023: 6911851. doi: 10.1155/2023/6911851. Elektroninė kolekcija 2023.PMID: 38075309 Nemokamas straipsnis apie PMC. Apžvalga.
• Organinių medžiagų pridėjimas laikinai perkelia morkų prokariotų bendruomenes į endosferą, bet ne į rizosferą.Bagchi I., Suzuki K., Asiloglu R., Harada N. Mikroorganizmai. 2023 m., rugsėjo 23 d.; 11 (10): 2377. doi: 10,3390 / mikroorganizmai11102377.PMID: 37894035 Nemokamas straipsnis apie PMC.
• Nauja ataskaita apie endofitinę bakteriją Achromobacter xylosoxydans iš Musa spp..Chohan P, Swarnakar S, Chakraborty AP Rep Mol Biol 2023 m. lapkritis;50(11):9179-9190. doi: 10.1007/s11033-023-08789-4. Epub, 2023 m. rugsėjo 30 d. PMID: 37776417
• Eksperimentinės nykimo sąlygos riboja augimą Phragmites australis .Bickford W.A., Snow D.S., Smith M.K.H., Kingsley K.L., White J.F., Kowalski K.P. 2023 m. kovo 2 d.;11(3):639. doi: 10.3390 / mikroorganizmai11030639.PMID: 36985213 Nemokamas straipsnis apie PMC.
• Naudingos augalų bakterijos ir galimas jų pritaikymas vertikaliose ūkininkavimo sistemose.Chiaranunt P., White J.F. Plants (Bazelis). 2023 m. sausio 15 d.;12(2):400. doi: 10.3390/plants12020400.PMID: 36679113 Nemokamas straipsnis apie PMC. Apžvalga.

Peržiūrėkite visus panašius straipsnius:

Endofitinis grybas sukelia mazgelių susidarymą ir N2 fiksaciją dėl specifinių šaknų eksudatų.

Xie XG, Zhang FM, Yang T, Chen Y, Li XG, Dai CC.mBio. 2019 m. liepos 16 d.; 10(4):e00728-19. doi: 10.1128/mBio.00728-19.PMID: 31311876 Nemokamas straipsnis apie PMC.

Simbiotiniai šaknų endofitiniai dirvožemio mikrobai didina pasėlių produktyvumą ir naudingi aplinkai.Harman J.E., Uphoff N. Scientific (Kairas). 2019 m. balandžio 2 d.; 2019 m.: 9106395. doi: 10.1155/2019/9106395. Elektroninė kolekcija 2019.PMID: 31065398 Nemokamas straipsnis apie PMC. Apžvalga.

Lyginamieji šaknų mikrobų sąveikos proteominiai tyrimai.Mathesius W. J. Proteomika. 2009 m. balandžio 13 d.;72(3):353-66. doi: 10.1016/j.jprot.2008.12.006. Elektroninis leidinys 2008, gruodžio 25 d. PMID: 19152841 Apžvalga.

Bakterijos, grybai ir archeologinės sritys rizosferos dirvožemyje ir jų įtaka didinant žemės ūkio produktyvumą.Odelade KA, Babalola OO Int J Environ Res Visuomenės sveikata. 2019 m. spalio 12 d.; 16 (20): 3873. doi: 10.3390/ijerph16203873.PMID: 31614851 Nemokamas straipsnis apie PMC. Apžvalga.Citata

· Kas paslėpta po žeme: požeminių augalų apsaugos strategijos.

De Koninck B, Timmermans P, Vos S, Cammu BP, Kazan K. Augalininkystės tendencijos. 2015 m. vasario mėn.;20(2):91-101. doi: 10.1016/j.tplants.2014.09.007. Epub 2014 m. spalio 9 d. PMID: 25307784 Apžvalga.

· Naudingų įsibrovėlių apgyvendinimas: evoliucinė ir molekulinė architektūra, kuria grindžiama augalų šaknų ir abipusių mikrobų sąveika..

Lagunas B, Schaefer P, Gifford ML.J Exp Bot. 2015 m. balandis; 66(8): 2177-86. doi: 10.1093/jxb/erv038. Epub, 2015 m. kovo 5 d. PMID: 25743160 Nemokamas straipsnis apie PMC. Apžvalga.

· Naudingi mikrobai patenka į žemę po šaknų imunitetu.

Yu K, Peters CMJ, Bakker PANM, Berendsen RL. Augalų ląstelės aplinka. 2019 m. spalis;42(10):2860-2870. doi: 10,1111 / vnt 13632. Epub, 2019 m. rugpjūčio 5 d. PMID: 31353481 Nemokamas straipsnis apie PMC. Apžvalga.

· Arabinogalaktano baltymai šaknų mikrobų sąveikoje.

Nguema-Ona E., Vikre-Gibouin M., Kannesan M.A., Driuich A. Augalininkystės tendencijos. 2013 m. rugpjūčio 18 d.: 440-9. doi: 10.1016/j.tplants.2013.03.006. Elektroninis leidinys, 2013 m. balandžio 24 d. PMID: 23623239 Apžvalga.

· Prijaukinimo ir žemės ūkio praktikos įtaka ankštinių augalų maistinių medžiagų įsigijimui per simbiozę su rizobijomis ir arbuskuliniais mikoriziniais grybais.

Liu A, Qu YS, Contador KA, Lam HM Front Genet. 2020 m. rugsėjo 30 d.;11:583954. doi: 10.3389/fgene.2020.583954. Elektroninė kolekcija 2020.PMID: 33193716 Nemokamas straipsnis apie PMC. Apžvalga.

Augalų ir mikrobų simbiozė kaip evoliucinis kontinuumas.

Provorovas N.A.Zh. 2009 m. sausis-vasaris;70(1):10-34.PMID: 19326852 Apžvalga. rusų.

Haustorijų susidarymas Medicago truncatula, užkrėstos Phytophthora palmivora, šaknyse nereiškia bendros endosimbiotinės programos, būdingos arbuskuliniams mikoriziniams grybams ir rizobijai..Huisman R., Baumister K., Brattinga M., Govers F., Bisseling T., Limpens E. Mol Augalų mikrobų sąveika. 2015 m. gruodžio 28 d. (12): 1271-80. doi: 10.1094/MPMI-06-15-0130-R. Epub 2015, spalio 29 d.PMID: 26313411 Nemokamas straipsnis.

Signalizacijos arbuskulinėje mikorizinėje simbiozėje.Harrison M.J.Annu Rev. Microbiol. 2005;59:19-42. doi: 10.1146/annurev.micro.58.030603.123749.PMID: 16153162 Apžvalga.

10Bendrosios sąjungos: abipusė augalų simbiozė su grybais ir bakterijomis.Martinas F.M., Urozas S., Barkeris D.G. 2017 m. gegužės 26 d.;356(6340):eaad4501. doi: 10.1126/science.aad4501.PMID: 28546156 Apžvalga.