Tinkama šiltnamio konstrukcija yra dar vienas itin svarbus kriterijus, į kurį svarbu atsižvelgti priimant sprendimą dėl šiltnamio pasirinkimo. Šiuo metu populiariausios medžiagos iš kurių yra pagaminta šiltnamio konstrukcija, yra cinkuotas plienas ir aliuminis. Cinkuotas metalas (pvz.: cinkuoti omega profiliai, cinkuoti vamzdžiai) yra tinkamas pasirinkimas, nes tokios konstrukcijos šiltnamiai yra atsparesni korozijai, nereaguoja su trąšomis.